クリップスタジオはフォトショップのインターフェースを意識してつくられていますので、フォトショップを使用されているのであればそれほど違和感は感じられないでしょう。
さまざまなドローイングソフト・ペイントソフトがありますが、AにできてBにできないという機能はそれほど多くなく、≪CGイラスト講座≫はクリップスタジオのオペレーションも学びますが、塗りのレクチャーが中心となり、その概念や着彩テクニックはほとんどのソフトで応用できるはずです。
なお、提出データはpsdデータで問題ありません。